อิลซังเคอร์เริ่มเล่นฟุตบอลกับทีมเยาวชนของแอร์สเทอฮัลเลินเนอร์ในฐานะผู้รักษาประตู แต่ภายหลังเปลี่ยนไปเล่นในตำแหน่งกองกลางแทน ต่อมาใน ค.ศ. 2005 เขาเซ็นสัญญากับเร็ดบุลซัลทซ์บวร์ค โดยจะได้เล่นให้แก่ทีมจูเนียร์ก่อน

ในวันที่ 4 เมษายน ค.ศ. 2009 อิลซังเคอร์มีชื่อเป็นตัวสำรองของทีมชุดใหญ่ในเกมลีกเป็นครั้งแรก ต่อมาเขาได้ลงเล่นนัดแรกให้แก่ทีมชุดใหญ่ในฟุตบอลถ้วยในประเทศเมื่อวันที่ 15 สิงหาคม ค.ศ. 2009[2] ต่อมาในวันที่ 25 สิงหาคม ค.ศ. 2009 เขาได้ลงเล่นระดับทวีปเป็นครั้งแรกในยูฟ่าแชมเปียนส์ลีกรอบคัดเลือกนัดที่พบกับมักกะบีไฮฟา หลังจบฤดูกาล 2009–10 เขาได้เซ็นสัญญากับเอ็สเฟา แมตเตอร์บวร์ก[3] ต่อมาใน ค.ศ. 2012 เขาย้ายกลับสู่เร็ดบุลซัลทซ์บวร์ค ซึ่งในครั้งนี้ เขาเป็นตัวหลักของทีมแล้ว โดยเขาได้ต่อสัญญากับสโมสรไปจนถึง ค.ศ. 2018

ในวันที่ 31 มกราคม ค.ศ. 2020 อิลซังเคอร์ย้ายร่วมไอน์ทรัคท์ฟรังค์ฟวร์ทด้วยสัญญาที่จะมีผลจนถึง ค.ศ. 2022[4][5]